Puskesmas Pabuaran Tumpeng berdiri pada tanggal 25 Oktober 1985 dan merupakan Puskesmas tertua ketiga di Kecamatan Tangerang setelah Puskesmas Sukasari dan Karawaci Baru. Seiring dengan berjalannya waktu, Kecamatan Tangerang mengalami pemekaran menjadi Kecamatan Tangerang dan Kecamatan Karawaci. Puskesmas Pabuaran Tumpeng masuk ke wilayah Kecamatan Karawaci dengan wilayah kerja meliputi 4 kelurahan, yaitu Kelurahan Pasar Baru, Bugel, Pabuaran Tumpeng dan Gerendeng, serta memiliki 2 pustu, yaitu Pustu Pasar Baru dan Pustu Bugel. Namun, sesuai perkembangan waktu, Pustu Pasar Baru dan Bugel menjadi Puskesmas sendiri. Sementara, Wilayah Kerja Puskesmas Pabuaran Tumpeng menjadi 5 Kelurahan, yaitu Kelurahan Pabuaran Tumpeng, Nambo Jaya, Gerendeng, Sukajadi dan Sumur Pacing, ditambah 1 Pustu Nambo Jaya dan Pusling Wilayah Kelurahan Gerendeng.

Tahun 2012, lokasi Puskesmas Pabuaran Tumpeng dipindahkan oleh PEMDA ke Komplek Perumahan Benua Indah, masih di Kelurahan Pabuaran Tumpeng, dengan luas tanah   1.720 m², sedangkan bangunan 556 m², dengan wilayah kerja yang sama.